Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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