Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms