Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Subh2bvQ9D9Z7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms