Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmco5aQ9D9D5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms