Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms