Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc91Q9D8L5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms