Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms