Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rab11fip1Q9D620 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rab11fip1Q9D620 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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