Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms