Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
4933428G20RikQ9D3X4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms