Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Snx29Q9D3S3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Snx29Q9D3S3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Snx29Q9D3S3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Snx29Q9D3S3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Snx29Q9D3S3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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