Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms