Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Zbed3Q9D0L1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Zbed3Q9D0L1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Zbed3Q9D0L1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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