Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndc80Q9D0F1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndc80Q9D0F1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndc80Q9D0F1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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