Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms