Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms