Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Otud1Q9CUB6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otud1Q9CUB6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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