Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q9CRC3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9CRC3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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