Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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