Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms