Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms