Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms