Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms