Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms