Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms