Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clip1Q922J3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms