Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms