Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Uhrf1Q8VDF2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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