Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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