Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ClmpQ8R373 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClmpQ8R373 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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