Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Impg1Q8R1W8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Impg1Q8R1W8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Impg1Q8R1W8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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