Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms