Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gtf3c1Q8K284 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gtf3c1Q8K284 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gtf3c1Q8K284 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gtf3c1Q8K284 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gtf3c1Q8K284 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c1Q8K284 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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