Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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