Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FgbQ8K0E8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FgbQ8K0E8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FgbQ8K0E8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FgbQ8K0E8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FgbQ8K0E8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FgbQ8K0E8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FgbQ8K0E8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FgbQ8K0E8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FgbQ8K0E8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms