Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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