Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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