Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp27Q8CEG8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms