Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atad2Q8CDM1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms