Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms