Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CCC3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms