Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc15Q8C9M2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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