Protein–RNA interactions for Protein: Q8C176

Taf2, Transcription initiation factor TFIID subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf2Q8C176 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf2Q8C176 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf2Q8C176 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms