Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne1Q8C166 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms