Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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