Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sfr1Q8BP27 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sfr1Q8BP27 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms