Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Atg4dQ8BGV9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Atg4dQ8BGV9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Atg4dQ8BGV9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Atg4dQ8BGV9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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