Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms