Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dusp4Q8BFV3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dusp4Q8BFV3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms