Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Amigo1Q80ZD8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Amigo1Q80ZD8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Amigo1Q80ZD8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Amigo1Q80ZD8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms